Arrivé le 24 août 2005, le lendemain de la victoire en Coupe Intertoto, ce transfert est une surprise vu que l'OM renfloue les caisses du PSG (comme toutes les intersaisons depuis des années) alors que le même jour Laurent Batlles et Sylvain N'Diaye partent.
En 2005-06, il joue quelques fois stoppeur (avec une certaine réussite) mais revient vite à son poste de prédilection, milieu récupérateur, avec tout autant de succès. Il s’adapte rapidement au club et est définitivement adopté par le public en marquant l’unique but du match contre son ancien club. Il a été d’une incroyable combativité durant toute sa première saison en Blanc. Il est d'ailleurs le Phocéen le plus régulier sur l’ensemble de la saison.
Après une deuxième saison phocéenne tout aussi remarquable, il prolonge son contrat de 3 années supplémentaires. Son bail avec l'OM se termine donc en 2012.
2007-08 est dans la lignée des précédentes, c'est-à-dire complète et performante. Le capitaine marseillais a aussi fini la saison comme défenseur central, pour pallier les défaillances de l'effectif.
En 2008-09, il est toujours le capitaine olympien et fait une bonne saison où son équipe rate le titre de Champion de France de peu.
Durant l'inter-saison 2009-10, il décide de changer d'air et s'engage avec le modeste club anglais de Sunderland. L'OM ne touche qu'une somme d'environ 6M d'euros.
seb, le 24 juillet 2009
